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Wenn ich jetzt z.B.
http://www.patch-your-games.com/js/jquery.colorbox-min.js
aufrufe, dann will der Browser die gz Datei herunterladen.
Wenn der Browser die Datei bei Direktaufruf herunterladen möchte, wird er sie nicht als js Datei einbinden.
Die Datei, die der Browser hier herunterladen möchte, hat nur die Endung .gz, nicht .js.gz - deswegen kommt die AddEncoding hier wieder nicht zum Zuge
Ein bloßes .gz wird alle Dateien berücksichtigen, die auf .gz enden (inklusive js.gz)
AddEncoding x-gzip .gz
Edit: oder du fügst in der Datei noch das fehlende .js mit ein